卵圆孔未闭诊断的方法可以通过经胸的超声心动图进行明确诊断。较小且并没有开放的卵圆孔，需要进行卵圆孔未闭的经胸超声检查。当深吸气后屏气，卵圆孔有可能会开放，这时进行经胸超声检查，很可能会更清晰的显示。卵圆孔未闭诊断的方法可经胸超声进行检测，因为分辨率在两毫米左右。因此，有较大分流的卵圆孔，可以通过经胸的超声心动图进行明确诊断。但是，有较小卵圆孔，并没有开放的卵圆孔，需要进行卵圆孔未闭的经胸超声检查。当深吸气后屏气，卵圆孔有可能会开放，这时进行经胸超声检查，很有可能更清晰显示。卵圆孔未闭需要经过经食道的超声心动图才能明确诊断，经食道超声心动图避免胸部、肺部对超声探头的干扰，更能够清楚的显示心脏的结构。如果有卵圆孔未闭，也能够明确诊断。