如果长期早上不刷牙，危害较大，可以导致龋病或者牙周病。如果长期早上不刷牙，口腔内的微生物就会在牙齿表面形成牙菌斑生物膜。而进食早餐后，口腔微生物在牙菌斑生物膜生态环境中，利用食物中的糖类代谢产酸，并堆积在牙表面，进而会引起牙釉质脱矿，形成龋损。此外，如果长期早上不刷牙，会造成牙菌斑堆积。如果不及时清除，会被唾液中的钙离子钙化，最终成为牙结石。