肛瘘的治疗，包括保守治疗和手术治疗。保守治疗只能控制感染，防止肛瘘发展，但不能根治。保守治疗方法有肛门熏洗坐浴，应用抗生素控制炎症。只有手术才能彻底根治肛瘘。手术切除内口，清除切开瘘管，使创面逐渐愈合，达到肛瘘治愈。手术方法有切开法、切开缝合法、切开挂线法、切开挂线对口引流等。