胎儿畸形的原因，与母亲的因素，父亲的因素以及胚胎本身的发育的因素导致有关。其中当母亲或者是父亲存在染色体异常时，胎儿畸形的可能性是很大。另外当母亲在怀孕的期间，尤其是在早孕期因为疾病因素的影响，或者因为母亲不良的习惯，比如抽烟喝酒，或者是母亲在孕期时接触有毒物质，都有可能会导致胎儿畸形的发生。因此在怀孕的期间女性，需要远离一切有可能对胎儿有不良影响的东西。