怀孕三个月时已经不能通过手术流产方式终止妊娠。手术流产最佳时间是在孕十周以前，怀孕三个月时胎儿器官肢体发育已经完成、骨骼也已经开始发育，通过一般负压吸引的手术流产方式，不能很好将宫内妊娠组织去除，需要结合钳夹方式进行手术治疗。在此阶段为了减少对子宫的损伤，一般会先进行药物流产，如果宫内妊娠组织没有完全排出再进行清宫手术治疗，可尽可能减少对生殖系统的损伤。