巧克力囊肿也可以怀孕。巧克力囊肿有可能会增加怀孕的难度，但是一旦怀孕对妊娠就没有进一步的影响。妊娠有可能会导致巧囊增大，但一般不会导致恶性变，也对巧囊不会有特别大的影响。妊娠之后有个别情况下，巧囊会发生破裂，表现为急腹症，但一般通过药物保守治疗都可以好转。