肠结核和克罗恩病的区别主要有以下两点：第一、病因不同。肠结核主要是由于感染结核杆菌所引起的，通常有肠外结核的病史。而克罗恩病主要是由于消化道的粘膜出现了慢性非特异性炎症所引起的。第二、治疗方法不同。肠结核主要是通过服用抗结核的药物来进行治疗。而克罗恩病主要是服用氨基水杨酸制剂类等药物进行治疗。