引起生化妊娠的原因有很多种，比如精子质量不过关、卵子质量不过关、胚胎质量不过关、子宫内膜的厚度与受容性异常。又或者女性有多次流产的情况、又或者母体自身的疾病，比如高血压，心脏病，贫血或者有不良的习惯，比如抽烟喝酒、甚至是吸毒，这些都会造成生化妊娠。