HPV16阳性怎么治疗，要结合宫颈细胞学检查的结果，以及阴道镜检查和活组织检查的结果，综合进行判断。若是单纯的HPV16阳性，需要进行抗HPV治疗，可选择干扰素类药物治疗。若HPV16阳性，同时伴有宫颈上皮内瘤变，需要进行宫颈锥切手术治疗。