指甲上有黑点原因有良性色素痣、恶性黑色素瘤、甲下出血、血栓、铅中毒、扁平苔藓、特发性出血性肉瘤等疾病。但最常见的是甲下出血。建议患者到当地医院的皮肤科就诊，明确诊断，对症治疗，才能取得好的治疗效果。如果是恶性黑色素瘤恶性程度比较高，应该尽快手术治疗。