胃窦溃疡有可能会癌变，癌变的情况常见于溃疡经久不愈，在反反复复修复的过程中可能会发生癌变。研究发现，胃溃疡发生癌变的几率在1%左右。胃窦溃疡除了发生癌变以外，还有消化道出血和梗阻的并发症，消化道出血主要症状表现为呕血或者黑便，如果发生梗阻病人会出现进食后上腹部饱胀，甚至呕吐宿食等症状。