包茎上长小水泡，常见的原因如下：一、生殖器疱疹，这种疾病一般是以由于疱疹病毒感染生殖器所导致，主要表现为阴茎以及包皮上面有小水泡，而且局部会有疼痛不适感。二、阴茎过敏，由于过敏原导致阴茎过敏，可表现为阴茎表面或者包皮有小水泡或者水泡联合成片，还可表现为阴茎瘙痒不适。