无痛肠镜和普通肠镜的区别在于，无痛肠镜是在全身麻醉的状态下进行的肠镜检查，患者在整个检查过程中处于麻醉状态，是没有任何痛苦的。而普通肠镜是在意识完全清醒的状态下进行检查，患者会在检查过程出现腹胀腹痛，腹部不适的症状。但是由于无痛肠镜检查需要全身麻醉，因此存在一定的麻醉的风险。所以对患者的心肺功能要求比较高。