怀孕40天肚子发胀考虑可能跟子宫逐渐增大牵拉周围的韧带有关系，也可能跟怀孕以后孕激素上升，胃肠功能蠕动变慢有关系。如果持续不能缓解要做B超确定宫腔孕囊的情况，如果有先兆流产，要配合保胎治疗进行改善。怀孕40天孕囊应该在一厘米左右，如果能够看到卵黄囊说明胚胎发育基本是没有问题的。