功能性消化不良的患者，可以服用莫沙比利等药物治疗，少部分患者因为消化酶缺乏，还可以服用多酶片或者复方消化酶类的药物治疗。功能性消化不良的患者，首先要改变饮食习惯，患者三餐定时、适量，多吃一些新鲜、清淡、有营养的食物。同时还需要进行药物治疗，患者可以服用促进胃肠蠕动的药物，例如莫沙比利，有助于改善功能性消化引起的不良症状。少部分患者因为消化酶缺乏，还可以服用多酶片或者复方消化酶类的药物治疗，能够补充消化酶，改善消化不良的症状。