月经干净之后仍然肚子痛，腰痛，这种情况可能存在盆腔炎。因为一些女性存在慢性盆腔炎，在身体状态比较差的情况下容易复发。所以，如果女性在月经期间休息不好，压力比较大，免疫力抵抗力下降，在月经干净之后就容易导致慢性盆腔炎的复发，从而出现肚子痛，腰痛的症状。可以做B超看一下是否有盆腔积液来确定是否是盆腔炎复发。