龟头长水泡疼可能是生殖器疱疹。生殖器疱疹是由疱疹病毒感染引起的，患者的阴茎以及龟头上会出现小水泡，小水泡周围会出现疼痛。患者应在医生指导下使用抗病毒药物治疗，比如阿昔洛韦。若生殖器疱疹周围继发感染，则还需使用抗生素进行治疗。