新生儿心脏缺损考虑先天性心脏病，其病因分为遗传因素和非遗传因素。由于在怀孕期间如果存在宫内感染，如风疹病毒、Eb病毒感染，会导致先天性心脏病。另外，如果母体有营养不良，伴有糖尿病、高血钙以及高血压等疾病，也会使胎儿在发育过程当中导致心脏畸形。如果在出生时早产，可能会导致室缺和动脉导管未闭，这样也会导致先天性心脏病的出现。