男孩青春期发育延迟的原因常见以下几种：一、体质性青春期延迟。这种情况与遗传因素有关，一般有相应的家族史，其影响因素约占40%。二、营养不良。由于孩子饮食习惯不良，喜欢挑食、偏食、易造成营养不良以及各种微量元素、维生素缺乏等，致使孩子生长发育受阻，出现青春期发育延迟现象。三、早产。早产的孩子由于其基础体质较差，身后追赶生长较差，因此，也可出现青春期发育延迟。四、各种疾病也可导致孩子青春期发育延迟，如染色体疾病、骨骼疾病、内分泌代谢性疾病以及其他的慢性疾病；另外，孩子作息时间紊乱，心理因素等也可导致。