发生矮小有很多的原因，有先天原因，也有后天原因。先天遗传问题，如Turner综合征等。后天因素可包括生长激素的缺乏以及代谢性骨病等。矮小症的发病原因较多，可分为先天性因素和后天性因素两类，先天遗传问题，如Turner综合征等，都会导致患者出现矮小症状。最常见矮小原因是指内分泌方面疾病，如最常见的生长激素缺乏、甲状腺激素缺乏、皮质醇增多或者是由于其他的原因肿瘤等其他的原因造成。