新生儿腹泻的原因有以下几种：一、新生儿消化系统发育不成熟，肠道的正常菌群还没有建立，消化能力弱。二、腹部受凉或饮食不当，引起消化不良。三、肠道感染引起炎症。四、食物不耐受，引起肠道过敏。五、身体其他系统疾病，引起症状性腹泻。