新生儿如果手指甲根部发黑，要考虑以下情况：一、宝宝手指甲存在外伤，如被夹伤或者撞击，导致甲床瘀血，指甲根部发黑。二、患有甲母痣，属于皮肤科疾病，从而导致指甲根部发黑，此时需要及早皮肤科排查是否存在着恶性病变的情况，明确病因后必要时对症处理。