甲状腺结节发病的原因有遗传因素和环境因素。遗传因素包括基因突变、甲状腺激素受体抗体缺陷、线粒体异常、家族中有甲状腺瘤或者家族性腺瘤样息肉病等。环境因素包括放射暴露增加、甲状腺激素和生长激素促进甲状腺癌生长以及其他的因素。