少部分患者可遗留后遗症，主要是神经系统的后遗症，如智力障碍、癫痫、脑积水等。脑膜炎根据致病的病原微生物的不同，可以分为化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎、病毒性脑膜炎等。脑膜炎病死率以及致残率较高，预后与病原体、患者具体情况、是否及时得到有效的治疗密切相关。