跖疣可以通过外用药物治疗，通常情况下可以外用五妙水仙膏，咪喹莫特乳膏，或者五氟尿嘧啶乳膏治疗。使用这些药膏的时候注意保护疣体周围正常的皮肤，以免损伤，另外可以二氧化碳激光或者电灼等方法治疗，也可以冷冻治疗，还可以光动力治疗。光动力治疗效果相对较好，复发的可能性小，但是光动力治疗比较贵。