男人尿道疼的原因如下：一、泌尿系统感染或者结石，比如尿道炎、尿道结石，均会导致尿道局部黏膜损伤，可引起尿道疼痛，还伴有排尿频繁、尿急等症状。可通过泌尿系统B超、尿常规等检查明确诊断。二、如果男性在性生活时用力过大，会导致尿道内的黏膜损伤，也容易导致尿道疼痛。