指甲凹陷，可能是由于多种的疾病所引发。比如外伤，长期接触水，潮湿与干燥环境交替以及脆甲等，均可引起指甲的凹陷。

某些系统性疾病，比如雷诺病，肝病，维生素缺乏，糖尿病，斑秃，银屑病，扁平苔藓等，都可引起指甲凹陷。