前庭大腺囊肿主要的发病原因，是前庭大腺的开口被堵塞。正常情况下在阴道口下方两侧有前庭大腺的每侧一个，如果是有一侧的前庭大腺炎开口发炎，会造成开口的黏连出现开口堵塞，从而形成囊肿。如果是出现感染，会形成前庭大腺的脓肿。