婴儿做核磁共振对大脑没有损害。核磁共振不存在射线，所以对婴儿没有射线损伤。当医生判断婴儿需要做核磁共振检查来明确诊断时，要配合医生进行核磁共振检查，以免延误诊断和治疗。做核磁共振之前往往要给婴儿应用镇静药物，药物有一定副作用，仅仅做一次核磁共振使用一到两次镇静药物对婴儿危害比较小。