孕酮片的副作用是导致胃肠道的反应。孕酮会降低胃肠道的蠕动能力，孕酮会导致水分的潴留引起水肿，继而导致体重增加。孕酮还可能引起痤疮、过敏性皮炎、精神压抑、性欲改变等。如果长期服用孕酮，还可能使得子宫内膜萎缩，出现月经量减少 。如果在怀孕期间服用孕酮，主要的副作用是头晕。