先天性心脏病球囊瓣膜成形术适用于主动脉瓣狭窄、肺动脉瓣狭窄、主动脉缩窄、房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等疾病治疗。先天性心脏病球囊瓣膜成形术通常被称为球囊扩张术，最多应用于肺动脉瓣狭窄球囊扩张成型，极少部分可以针对主动脉瓣进行球囊扩张，但是风险比肺动脉瓣球囊扩张高。所以特定病人、特定类型可以尝试先天性心脏病球囊瓣膜成形术。其他瓣膜，包括二尖瓣、三尖瓣狭窄球囊扩张不太成熟，一般不会推荐。