只有孕囊没有胚芽主要有两种原因：第一、由于怀孕时间尚短，宫内的妊娠组织还没有发育到出现胚芽的阶段。第二、由于出现了胎停育的现象，所以没有胚芽和胎心。如果只有孕囊没有胚芽，可以通过定期监测B超以及人绒毛膜促性腺激素上升的情况进行综合性评估，然后判断原因。