真菌性包皮龟头炎一般可以涂抹克霉唑软膏或者硝酸咪康唑乳膏，同时可以考虑口服伊曲康唑或者氟康唑来进行抗真菌治疗。真菌性龟头炎绝大多数是因为与女性发生性行为所造成的交叉感染，因此需要男女双方同时治疗，才有可能彻底解决真菌性龟头炎的问题，在恢复正常前不要进行性生活。