肝脓肿的最佳治疗方法，根据患者肝脓肿情况来进行判断的。如果患者所患的是急性细菌性肝脓肿，一般情况下可以选择药物治疗来进行保守治疗。如果患者所患的是厚壁慢发性的肝脓肿，或者是肝脓肿在切开引流之后出现的不塌陷，或者留有窦道等情况，通常可以选择手术治疗。