阴茎上有水泡常见的原因如下：一、生殖器疱疹。一般是疱疹病毒感染阴茎导致，主要通过性接触传播。患者还会有患处疼痛现象。二、阴茎皮肤过敏。当阴茎皮肤接触过敏原之后，出现过敏反应，就会有水泡现象，还有痒症、皮疹等症状。需要用抗组胺药物以及避免过敏原治疗。