心理咨询师证书是由国家相关部门颁发的，用于证明持证人具备从事心理咨询工作的资格和能力，心理咨询师证书的发放主要由以下几个部门负责：

1、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会是全国性的专业心理卫生组织，负责组织心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过中国心理卫生协会组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师证书。

2、各省市心理卫生协会：各省市心理卫生协会是中国心理卫生协会的地方分会，负责组织本地区心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过各省市心理卫生协会组织的心理咨询师资格考试，也可以获得心理咨询师证书。

3、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是中国政府主管卫生健康工作的部门，负责制定和实施心理健康政策，国家卫生健康委员会下属的心理卫生中心也承担着心理咨询师的培训、考试和认证工作，通过国家卫生健康委员会心理卫生中心组织的心理咨询师资格考试，可以获得心理咨询师证书。

4、高校和职业培训机构：部分高校和职业培训机构也提供心理咨询师的培训和认证服务，通过这些机构组织的心理咨询师资格考试，也可以获得心理咨询师证书。

需要注意的是，不同部门颁发的心理咨询师证书在法律效力上是相同的，但在社会认可度和影响力上可能存在一定的差异，在选择参加心理咨询师培训和考试时，可以根据自己的实际情况和需求，选择合适的部门和机构。

心理咨询师证书的发放主要由国家相关部门、地方心理卫生协会、国家卫生健康委员会下属的心理卫生中心以及高校和职业培训机构负责，通过这些部门和机构组织的心理咨询师资格考试，可以获得具有法律效力的心理咨询师证书。