甲状腺球蛋白偏低由多种原因造成，可能是甲状腺功能先天性低下，也有的重症肝炎、失代偿肝硬化等肝脏疾病，肝脏本身合成蛋白的能力下降，也会导致甲状腺球蛋白偏低。另外，甲状腺手术切除部分的患者，还有可能见于外源性甲状腺激素药物，以及在饮食中缺碘，都会造成甲状腺球蛋白偏低的现象。