月经干净几天做B超需要考虑做B超的目的，如果要了解是否存在子宫内膜息肉以及是否存在子宫内膜增厚现象，一般建议月经干净后做B超。如果需要了解是否子宫内膜存在过薄的现象，一般在来月经前要做B超，如果需要了解卵巢的储备功能，往往在月经期做B超。