奥美拉唑有可能会出现以下副作用，首先表现为口干、恶心、呕吐、腹胀、便秘以及腹泻、腹痛等。同时还可能会出现一过性的转氨酶升高，以及胆红素的升高。但是多为轻度短暂的，大多不影响疗效。同时有些患者可出现感觉异常头晕、头痛、嗜睡、失眠以及外周神经炎等。此外长期应用奥美拉唑，可以导致维生素B12的缺乏。还有可能会出现肿瘤、皮疹、溶血性贫血等。