月经不干净的原因可能是子宫、卵巢有器质性疾病，比如出现了多发性子宫肌瘤、子宫腺肌症、粘膜下子宫肌瘤、子宫内膜息肉、子宫切口憩室，都会导致月经持续的时间比较长。如果有内分泌不调，黄体功能不全，在来月经的时候因为体内的孕激素水平比较低，内膜脱落的比较慢，也会导致月经持续的时间比较长。