幽门螺旋杆菌四联疗法的副作用是药物之间的副作，比如阿莫西林会有过敏现象，如皮疹、恶心、呕吐等。克拉霉素的副作用是导致胃肠道不适。果胶铋剂则会引起黑便、便秘等。建议患者在医生的指导下服用四联药物，并在用药期间合理饮食，还要定期复诊，以减少用药不良反应。