脑部的核磁共振主要用于各种脑血管疾病、脱髓鞘的病变、颅内的肿瘤颅脑的先天发育异常、颅脑的外伤和各种原因导致的颅内感染，对于以上的疾病均有明确的诊断的价值。与头颅CT相比，核磁共振能提供多方位和多层面的解剖学信息，图像清晰，并且不会出现伪影；可以清晰地显示脑干以及后颅窝病变的形态，位置，大小以及周围组织结构的关系。