胎儿心脏畸形主要有以下几个方面原因：第一、在怀孕的早期受到了病毒细菌的感染所引起器官发育异常。第二、怀孕的早期接触过多的放射性物质以及有毒有害的化学制品，包括药品。第三、由于家族性的遗传所导致胎儿心脏畸形。出现胎儿心脏的异常，要考虑到心脏异常的严重程度以及出生后是否能及时的通过手术治疗对其进行改善。