男性阴茎上起小水泡可能是受到疱疹病毒感染，其原因可能是有不洁的性接触，且感染相应病毒，属于一种性传播疾病，可表现为阴茎出现小水泡，部分患者还可伴有疼痛或者瘙痒症状。除此以外，部分患者是因为阴茎受到外伤刺激或者过度手淫习惯所致。如果存在上述问题，则可选择抗病毒药物治疗；在治疗期间，男性尽量避免性生活。