新生儿便便有酸臭味最为常见的原因是肠道感染，其次是消化不良。如果是新生儿肠道感染所致，往往大便中会有奶瓣，需要检查大便常规了解大便的性质，可以适当给予抗生素进行治疗。如果是消化不良引起的大便酸臭，可能会伴有舌苔过厚的症状，需要给予腹部按摩进行缓解。同时，需要注意喂养。