宝宝咳嗽灌肠的危害主要是灌肠易造成直肠损伤或者长期灌肠导致宝宝出现腹泻症状，但上述情况发生的概率比较少，家长不必过度担心。灌肠在临床上较为常见，药物可以通过直肠直接吸收，可以减少孩子喂药困难和注射疼痛，所以临床应用效果较好。