肌肉萎缩的原因有很多。上肢肌肉萎缩的原因包括颈椎病、肘管综合征、腕管综合症、胸廓出口综合征等等。而下肢肌肉萎缩最常见的原因包括腰椎间盘突出症、椎管狭窄症等因素。周围神经病变等因素也是导致肌肉萎缩的原因之一。另外，由于外伤、骨折所导致患者不能进行良好的功能锻炼，所产生的是肌肉废用性萎缩，也是肌肉萎缩所常见的原因之一。