怀孕两周如果是指同房两周，这时候不能药流，因为药物流产要看到孕囊。一般怀孕时间从末次月经算要达到六周左右，按照同房时间算最少要达到四周才可以看到孕囊大小，才可以选择药物流产。在药物流产过程中也要注意七天左右要复查，确定是否药流成功。