新生儿肠炎引起原因有很多方面，首先是肠道本身存在感染。如肠道有外界病毒或者细菌等病原体入侵、或者本身肠道里菌群发生失调紊乱，也会导致肠炎发生。还有全身性疾病炎症因子、炎症介质释放到肠腔刺激肠道产生炎症反应，也会出现肠炎。