小孩足跟血检查主要检查先天性遗传性代谢疾病。最常见的是四病筛查，包括苯丙酮尿症、先天性甲状腺功能低下症、地中海贫血、先天性肾上腺皮质增生症。随着串联质谱技术的普及，现在有的地方也检查脂肪代谢性的疾病，氨基酸代谢性的疾病。